提交人:林崇熙
烏腳綠竹轉錄基因組 林崇熙*
台灣中央研究院農生中心,台北 *通信作者:Tel: (+866) 227885114; E-mail: cslin99@gate.sinica.edu.tw
摘要 竹是亞洲地區重要的經濟作物.到目前為止,其基因組等相關的研究仍不似其他模式植物先進.在先前的研究中我們可以利用組織培養的方式來控制一個台灣特有種:烏腳綠竹(Bambusa edulis)在試管內控制開花.為了了解試管內提前開花作用的機制, 我們利用高通量定序的方法進行烏腳綠竹轉錄基因組的研究.將試管內的根,莖,葉,花等材料,抽取其RNA作為資料庫的來源.經過生物資訊的分析,我們可以得到35205 unigenes(平均長度為359).這些序列我們進行了後續的生物資訊的分析.其中我們對於與花朵發育有關的MADS基因進行更深入的研究.發現目前在水稻與花朵發育有關的基因皆在烏腳綠竹有其相對的基因.我們認為這個資訊對於我們後續的研究有很大的幫助.
关键词:MADS, Flowering, Next generation sequencing
|